Функциите на Секретариат на ОПТ се изпълняват от отдел „Мониторинг, информация и комуникация" на УО на ОПТ.

Тези функциии се изразяват в следното:

1. Организиране на подготовката и провеждането на заседанията
2. Осигуряване разпространението на дневния ред и на всички документи, необходими за провеждането на заседанията
3. Изготвяне на протоколите от заседанията
4. Водене на отчетност за становищата и решенията, взети на заседанията
5. Подготовка и предоставяне на членовете на КН всички документи, необходими за осъществяване на техните функции
6. Координиране на изпълнението на решенията и необходимия обмен на информация между заинтересованите страни
7. Подпомага председателя на КН на ОПТ при осъществяване на функциите му
8. Съхраняване документите от заседанията на комитета

Цялата кореспонденция, свързана с работата на КН се адресира до Секретариата.