Функции:

• Подготовка и промяна на ОПТ;
• Идентифициране на проекти за финансиране от ОПТ;
• Координация на подготовката на проекти, предвидени за финансиране от ОПТ;
• Преглед и съгласуване на Формуляри за кандидатстване за инвестиционни проекти под  и над 50 млн. евро и изпращането им в ЕК;
• Преглед и одобрение на Формуляри за кандидатстване за инвестиционни проекти и проекти за техническа помощ; 
• Информиране на другите отдели в УО и бенефициентите на ОПТ относно тенденциите и промените в Кохезионната политика на ЕС;
• Координация на дейностите по изготвяне на проектни предложения за финансиране от бюджета на Транс-европейската транспортна мрежа (TEN-T ) и изпращането им в ЕК;
• Изготвяне на финансови прогнози и планиране на средствата за ОПТ, включващи средствата от КФ, ЕФРР, националното съфинансиране и други финансиращи институции;
• Координация на дейностите, свързани със съвместната работа с МФИ и JASPERS;
• Координация на дейностите по подготовка и промени на Процедурния наръчник на УО;
• Координация на дейностите по изготвяне и промени на Оперативните споразумения с бенефициентите на ОПТ  ;
• Координация на дейностите по изготвяне на планове за обучение на служителите в УО;
• Изготвяне и прилагане на Организационната стратегия за развитие на УО;
• Изготвяне на периодичен анализ на административния капацитет на бенефициентите на ОП  „Транспорт”;
• Изготвяне на Индикативната годишна работна програма в съответствие с изискванията на чл. 9 от ПМС № 121/31.05.2007 г., последно изм. ДВ. бр.54 от 15.07.2011г.;
• Участва в изготвянето на Насоките за кандидатстване по ОПТ;
• Участва в изготвянето на договорите/заповедите за предоставяне на безвъзмездна финансова помощ;
• Попълва информацията в системата за финансово планиране и наблюдение LOTHAR, като за целта актуализира данните за изпълнение на програмата във „Флаш” („Flash”) таблицата и N+2/3 таблиците, на едномесечна база и въвежда прогнозите за финансовото изпълнение на ОПТ в N+3/2 таблиците, на годишна база.

Забележка: Принципите на работа по отношение на попълването на N+3/2 и „Флаш” таблиците в системата за планиране и наблюдение LOTHAR са определени в насоки за попълването на таблиците на системата LOTHAR на Европейската комисия .